太阳系被称为「奇居子」的谜之生命体破坏殆尽后的1000年后，在维持人类繁殖和生产、于宇宙中飞行的播种船希德尼娅上生活的少女「谷风长道」成为了巨大人型兵器「卫人」的操纵士训练生，在进入训练学校之前从未接触过爷爷以外的人，在这里他遇到了让他第一次意识异性存在的少女「星白闲」；而他的结...